Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms