Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsponQ3UPR9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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