Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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