Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf224Q3UIW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf224Q3UIW8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf224Q3UIW8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf224Q3UIW8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf224Q3UIW8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms