Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms