Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll12Q3UDE2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms