Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ssbp4Q3U4B1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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