Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms