Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms