Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Shcbp1lQ3TTP0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Shcbp1lQ3TTP0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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