Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms