Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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