Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms