Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms