Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rhox4dQ2MDG0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms