Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b1Q148W0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b1Q148W0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms