Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms