Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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