Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms