Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms