Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms