Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms