Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms