Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl7Q03366 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms