Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Thbs2Q03350 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Thbs2Q03350 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms