Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms