Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms