Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd1Q01822 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms