Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms