Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms