Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms