Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms