Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms