Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms