Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms