Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms