Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms