Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mesp1P97309 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mesp1P97309 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mesp1P97309 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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