Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms