Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cplx1P63040 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cplx1P63040 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms