Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gabra1P62812 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms