Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps11P62281 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms