Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp46P62069 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms