Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lmo4P61969 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms