Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms