Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpa1P57784 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpa1P57784 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms