Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms