Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms