Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FanccP50652 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FanccP50652 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FanccP50652 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms