Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms